Identificação e caracterização in silico de pequenas proteínas na archaea Halobacterium...

A utilização da biologia sistêmica como abordagem que integra análise de dados em escala genômica com ferramentas de bioinformática permitiu, por exemplo, a descoberta de diversas regiões genômicas codificadoras de pequenas proteínas e peptídeos (smORFs). Estas moléculas eram até então negligenciadas ou em alguns casos, chamadas erroneamente de RNAs não codificantes (ncRNAs). Tais descobertas levaram a diversos estudos sobre as funções biológicas destas proteínas, que possuem importantes papéis regulatórios em todos os domínios da vida. Assim, o presente estudo visa a busca por novas pequenas proteínas na haloarquea Halobacterium salinarum, um importante modelo no estudo sistêmico de organismos halófilos. Para tal, foram utilizadas ferramentas de bioinformática para análise de smORFs codificantes de proteínas pequenas (MM<10kDa) identificadas a partir de peptídeos obtidos por LC-MS. Esta abordagem permitiu a identificação de 5 possíveis proteínas codificadas por smORFs intergênicas ou antisenso, e a identificação de regiões conservadas e motivos estruturais em comum que podem auxiliar a sugerir funções para estas moléculas. Como consequência destas análises, foi possível sugerir melhorias na anotação do genoma deste organismo. Além disso, foi realizada a padronização de técnicas de biologia molecular, como a marcação cromossômica e a expressão por vetores a fim de validar a expressão de proteínas com marcadores moleculares adicionados na região C-terminal, permitindo a identificação destas por Western blot

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Data de Publicação

2016-04-12

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